1638年2月9日，总检察官约翰·班克斯爵士指控约翰·李尔本拒不答辩、未依法登记出庭，且断然抗拒星室法院之宣誓。随后当庭宣读的奇灵顿证词，直指李尔本与约翰·沃顿曾在鹿特丹印刷多篇攻讦主教的檄文。李尔本力求当庭自辩。他陈述道，奇灵顿本是因私贩禁书被捕，为求自保脱罪才攀诬他人；他断然否认曾策划运送上述书籍，并严词要求与指控者当面对质。沃顿亦试图发言，痛斥主教强加于人的宣誓之弊。众领主法官命其依题答话，老者却辞色不屈，抨击如故。法庭先是哄堂大笑，继而强令其噤声。最终，二人皆誓不遵从那项概括性誓言。
早在1636年，李尔本便离开伦敦远赴荷兰，随身携带着医师约翰·巴斯特威克痛击主教制度的文稿。彼时巴斯特威克因著书立说正被囚于门楼监狱。李尔本携其檄文《欢愉礼拜文》及其他同类小册子返英，并暗中散发。对于此番差使，他并不抵赖，所抗辩者乃是强加于己的罪名性质与罗织细节。该案将其姓名与年长印刷工约翰·沃顿紧密相连——后者的工坊及其与各大书商的往来，均被卷入同一起密查之中。
1637年12月11日或12日，李尔本与沃顿的佣工约翰·奇尔本正行经索珀巷，突遭一名缉差及四名随从拘捕。翌日正午，他被解往门楼监狱；不足三日，又奉枢密院之命移解舰队监狱。官府声称，收押他是因其自荷兰运进违禁书刊。李尔本在狱中呈递请愿书力求还其自由，得到的答复却是：必须先接受总检察官约翰·班克斯爵士的勘问。
据李尔本亲笔自述，审讯自他在阿姆斯特丹和鹿特丹所接触的书肆、资金往来与人事流转层层盘查。他承认曾见过一个叫哈古斯特的人，也结识埃德蒙·奇灵顿。然而，他坚决否认运送书籍，并严正抗议对第三人的穷追猛问早已超出了当初捕人的由头。当被问及是否认识约翰·沃顿，他起初对其全名略有迟疑，随即认出这名装订兼印刷师傅。官府遂以奇灵顿的宣誓书相逼，指控他出资或促印了数千册檄文。李尔本凛然答称：此乃凭空捏造之辞。
整场勘问中最为惊心动魄的一幕，当属迫令签字之时。书记官将他的供述摘要写就，递上一份旨在坐实其口供的文书。李尔本坚称其文曲解本意，全然不符原话。他索取鹅毛笔欲亲书己见；不料班克斯见他刚写下数语，便一把夺下笔来，断定原案已然足够。李尔本继续身陷囹圄。稍后在星室法院案房，他又抗议道：官府既未送达传票，亦未出示正式控告书，便索要勘验进门费并强令其出庭。一名掌书吏则轻慢答复：自当先行审讯，控罪容后再拟。
争锋的焦点遂由檄文内容陡然转向了审讯程序。法吏企图逼迫李尔本发誓，必须对嗣后所提的一切质问知无不言。李尔本坚决要求预先知晓宣誓所涉事项。在他看来，一旦发下凡问必答的誓言，法庭不仅将以此套取其自身罪证，更将构陷牵连他人。档案记录下了他的决绝拒誓，随后亦记下了沃顿的不屈——老者慨然陈词，声称近两年来主教们因其抗拒同类毒誓，已将他先后辗转羁押于五所监牢。在再次提审之前，二人被严密监禁，剥夺了与亲友相见的一切权利。
2月13日，奇灵顿的另一份供词被当庭呈览，其上罗列了各类书目：指控李尔本印行巴斯特威克的数部著作，包括《对约翰·班克斯爵士告发书之答辩》与《祷文》；沃顿则被指资助印制了一份关于主教的《撮要》以及《新十六问》。李尔本再次痛斥这些攻讦之词。档案记录了这份告发与他的驳斥，却从未给予被告与奇灵顿当面对质的权利。
宣誓告发书赫然在案，而告密者却始终未曾露面以对质疑。据李尔本记述，法庭竟援引旧例，将此案比附于当年庇护天主教神父且拒不宣誓受审的嫌犯。李尔本严正抗辩，指明两造案情绝无类比之理，更兼控罪所指事实根本未得确证。然而法庭一意孤行，全凭一纸告密书及二人拒不宣誓之抗逆，定李尔本与沃顿各处五百镑重罚。李尔本更被判处鞭笞及枷刑；沃顿彼时依记载已八十有五高龄，虽免遭皮肉之苦，亦难逃枷号之辱。沃顿当庭怒斥主教专权，言辞激切，数度打断法官的诘问。判决既下，二人一度在狱内获准稍事行动。然而，沃顿抨击主教之语传入枢密院耳中，二人旋即复被锁入同一牢房，严加隔绝。约三周后，老朽体衰的沃顿经呈请方获保外就医，暂得苟安至下个开庭期。而李尔本，则依然沉沦黑狱。
1638年4月18日，李尔本被押往西敏。博罗记载，他在众目睽睽之下遭皮鞭沿街一路抽打，直至刑枷之下。他脊背血肉模糊，颈项被卡在刻意压低的木枷孔中，在烈日暴晒下示众近两个时辰。即便如此，他仍高声向围观民众揭露主教之酷虐，痛斥在未有原告对质之下所作判决之不公。舰队监狱典狱长厉声喝令其住口，继而用布条死死塞住其口。李尔本无法再发一言，便以足重踏木枷，声震刑台。行刑既毕，差役将其押解还监，由外科医生敷裹创口。李尔本为这一段受难记收尾时写道：文末署名，乃是蘸着自己淋漓之鲜血写就。
博罗的纪略随后勾勒了李尔本跌宕起伏的余生：1640年，议会准其保释，继而正式宣布当年的初审判决乃属专横与非法。然而冤狱之昭雪，并未平息后继之风浪。李尔本投身议会军效力，后因龃龉与长官决裂，转而严词抨击那些他曾浴血捍卫的体制。他曾被放逐海外，潜归后在老贝利法庭受审并获无罪开释。博罗笔下的李尔本，在生命终局的那一年，已然皈依了贵格会。